电子信息工程系属于先进制造工程学院，下设电子信息工程和通信工程两个专业，目前系部学生近800名。电子信息工程专业是我校设置的首批工科专业之一，其前身为合肥联合大学机电工程系于1988年设置的应用电子技术本科专业，1998年根据教育部本科专业目录更名为电子信息工程专业，2008年本专业获批安徽省级特色专业，2009年本专业获批第四批国家级特色专业，2014年本专业获批进行合肥学院模块化教学改革，2017年本专业进入安徽省一本批次招生。于2019年获批硕士研究生招生资格。
作为我校优势专业，现面向全国12个省市自治区招生，其中安徽生源约占 83.7%，2017年进入一本招生之后，当年的录取分数比一本分数线高出12分，去年2018年的最低录取分数比一本分数线高19分。，我系拥有雄厚的师资力量，专职教师30人，其中教授3人，副教授及高级实验师15人，具有博士学位教师8名，硕士以上学位教师占90%以上。
本专业自开办之日就坚持我校“地方性、应用型、国际化”的办学定位，在学习借鉴德国应用科学大学经验基础上，构建了具有鲜明特色的应用型人才培养体系，这主要体现在以下4个方面：
（1）教育教学理念国际化。
近年来，在学校的支持下本专业教师均在德国应用科学大学经过系统培训，借鉴德国先进教学理念，引入人才模块化培养概念，并具体实施到模块化人才培养实践中。与德国安哈尔特等高校建立人才联合培养
（2）以工程实践课程促进专业技能提升
在模块化人才培养方案中，我们增加了包括现代电子技术、现代检测技术等专业工程类课程的教学比例；此外，还安排以为期10周的认知实习和为期3周的毕业实习为核心的集中实践教学环节，目的是让学生获得更多理论联系实践的机会。
（3）建立了丰富的校内外实习实践基地。
本专业拥有专业教学实验室15个，例如SMT工程实训中心、PCB制版与检测中心、电子测量实验室、数字图像处理实验室、DSP实验室等，专业实验室使用面积约2027m2，生均教学仪器设备价值1.73万元。此外，学校有公共的物理、电路、数电、模电实验室，校工程实训中心。
本专业与多家大中型企业建有校企联合培养基地，本专业与12家校外企业建立了长期、稳定的实习基地，包括：合肥美的暖通设备有限公司、合肥宝龙达信息技术有限公司、合肥润东通信科技股份有限公司、合肥安达电子有限责任公司等；这些实习基地为本专业学生的认知实习、毕业实习提供工程实践平台，有效地促进了本专业培养目标的达成。
（4）开展第二课堂，提升学生学习内驱动力。
电子爱好者协会等以本专业实验室为依托。利用课余时间积极参与全国大学生电子竞赛、全国大学生智能车竞赛、中国智能制造挑战赛、全国“挑战杯”课外学术科技作品竞赛和创业计划赛、安徽省机器人大赛——单片机与嵌入式系统应用技能大赛等，并取得优异成绩。近三年，本专业共获得国家级奖项19项，省级奖项164项。
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