生命健康与环境工程学院实验实训中心现拥有面积5000多平方米实验室，仪器设备4000余台套，总价值6000余万元，其中有原子分光光度计、高效液相一质谱联用仪、流式细胞仪、TOC测定仪、激光光源双转盘共聚焦高内涵分析系统（进口）、质谱引导制备液相系统、高效液相色谱仪、生物3D打印机、超高分辨激光共聚焦显微镜、电感耦合等离子体发射光谱等大型精密仪器40余台。现有4个省级重点实验室（实训中心）：污水净化与生态修复材料安徽省重点实验室；生物工程与技术虚拟仿真实验教学中心；发酵工程及应用实训（实验）中心；应用酶学实验实训中心。共设置教学实验室45间，其中一楼发酵工程实验室、固废处理工程实验室、水处理工程实验室、四大名点实验室、啤酒生产实训中心等实验室，主要为工程类实验室；四楼主要为公共平台实验室（培养室、灭菌室、菌种室等）和专业实验室（基因工程 实验室、食品生物技术实验室、酶工程实验室等）以及分析测试实验室；五楼为环境工程和食品类专业实验室以及科研平台和分 析测试室等。

实验室拥有专职管理人员11人，其中高级实验师4人。另有教师兼职管理人员近10人。专职实验人员具有扎实的专业理论水平和丰富的实践能力，能独立承担多门课程的实验教学，多位教师主持或参与省、市和学院纵向、横向科研项目。实验中心每学年承担全院四个专业实验教学任务和300余人本科生毕业论文。并为院科研活动与大学生创新创业、挑战杯、 第二课堂等提供支持。实验中心先后承担了国家自然科学基金项目；国家863项目子课题、国家水专项子课题、国家固废专项子课题；中国科学院 海洋实验生物开放实验室研究项目；安徽省科技厅自然科学基金项目，安徽省科技厅攻关项目；安徽省教育厅自然科学项目，合肥市科委工业项目和产学研项目。获安徽省教育厅科技进步三等奖，安徽省自然科学三等奖，安徽省教育厅优秀科技成果二等奖等奖项。